《生物信息学》是工业和信息化部主管，哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物，报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。本刊于2003年9月创刊，季刊，国内统一连续出版物号：CN23-1513/Q，国际连续出版物号：ISSN1672-5565。

《生物信息学》主要刊载生物信息及相关领域的研究进展、综述、研究论文、研究简报、技术与方法、专题评论等学术文章。《生物信息》登载的研究论文应是没有在国内外公开出版的刊物上发表过的原始研究工作报告；综述进展应结合作者研究领域的工作，对相关领域的发展及研究进展进行全面的介绍和评述，及时反映生物信息领域的发展热点和最新进展；本刊还刊登有关生物信息技术国内外研究开发动态、简讯、产业政策与产业发展动态、学术活动与展会通知、书评、短评、启事等文章。

《生物信息学》为中国科技核心期刊，并加入了中国期刊全文数据库（CJFD）、万方数据库、中国核心期刊（遴选）数据库和中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）、中国生物医学文献数据库（SinoMed）等。2013年入选美国《乌利希期刊指南》（网络版）；本年度在美国《科学引文索引（扩展库）》（SCIE）施引文献数6篇，总被引频次7次。